虽然德川家光下令关闭商馆，扣压到港船只，抓捕中国商人，但经过初步审问，发现这只是普通商人，在商馆里也没发现别的什么东西，更没有发现丰臣氏做乱的证据。因此徳川家光也有些犹豫起来，难到这真的就是普通的经商吗？
而一直等待机会的岛津光久立刻出头向德川家光建议，事情到了这一步，有进无退，应该马上出兵，进攻琉球，然后威逼杭州，迫使商毅交出丰臣氏余众一干人。并且极力夸大中国的内战局势，现在商毅正在全力抵抗清军，根本无力顾及其他，在琉球的驻军也不多，而且都是从欧州招募来的雇佣兵，就也说明商毅抽不出自己的兵力驻守琉球了。因此这正是一个难得的好机会。如果等商毅和清军分出了胜负，可就不好办了。
徳川家光对日本以外的土地到是没有什么野心，也不想和中国全面开战，但他对丰臣氏的余众确实颇为忌殚，而且对中国的局势也有一定的了解，知道在去年明清之间展开了一场激战，双方的损失都不小，现在战事暂时停止，而维护丰臣氏余众的明朝将军商毅，是南方抵抗清军的主要力量，现在驻守在长江一带，而中国进入了南北对持的局面。
根据掌握的这些情况，德川家光也判断，现在虽然战事停止，商毅要全力抵抗清军发起进度进攻，因此确实没有余力和日本作战，岛津光久的建议有很大的成功把握。
随后德川家光又和自己手下的重臣酒井忠胜，松平信纲，阿部忠秋等人商议，也都认为此议可行。于是立刻下令，让萨摩藩为先锋，首先向琉球发动进攻，同时又调动各地大名的人马，准备大举登陆琉球，以兵势逼迫商毅交人。如果商毅还不肯交人，那么就由琉球进攻杭州或是台湾，进一步施压。
领命之后，岛津光久也不禁大喜过望，自从战败之后，他就在为复夺琉球做着准备，在藩内招集了五千士兵，进行严格训练，同时又咬紧牙关，打造战船，从荷兰人、葡萄牙人那里购买了千余支火枪，就是等着这一刻。因此也立刻回藩，招集家臣部众，准备夺回琉球。
这一次出战琉球，萨摩藩将出动八千左右的兵力，新建军队将全部出动，同时还动用船只六十余艘，藩主岛津光久也将亲自为全军的主将，现存的家老新纳原忠和他的儿子新纳四郎次源，家臣桦山久孝、长裕义行、平田宗次郎等人，还有岛津光久的几个弟弟：老六町田忠尚，老九岛津久雄、老十三伊势贞昭，等人也都悉数出战。
现在的萨摩藩在日本只能算是二流大名，能够抽调出这样规模的兵力，也差不多就是萨摩藩的极限了，可以说为了夺回琉球，萨摩藩己经是倾尽全力，孤注一掷了。
而在出兵的同时，岛津光久又下令先其潜入琉球的家臣桦山久孝开始在琉球发动突袭。
桦山久孝是在二个月前带领三百士兵潜入琉球，因为这时琉球的日势力正是急聚膨胀的时候，因此有他们掩护，琉球全国对此一点察觉也没有。而桦山久孝的到来，也使琉球的亲日势力全部欣喜若狂，大有终于等来组织之感。
琉球亲日势力手里的人手加在一起约有一千五六百人，收到了岛津光久的命令之后，桦山久孝也立刻开始行动，就手头上的这些人，他当然不敢去进攻西班牙雇佣军的军营，但对首里城却毫无惧畏，因此首先对首里城展开进玫。
就在八月十七日夜，桦山久孝率领着萨摩士兵和琉球亲日势力，与琉球王朝中的亲日派里应外合，袭击了首里城。而琉球朝廷对此毫无察觉，因化首里城里也一点防备都没有，结果被萨摩军一鼓作气杀进了首里城，包围了王宫，一夜之间，琉球王尚贤以及琉球王室全部都成了萨摩军的俘虏。王室的财富也全部都成了萨摩军的战利品。
虽然首里城里还有二三千余名士兵，但根本就不是萨摩军的对手，两军一经交战，就被萨摩军打了一个落花流水，大部份都投降了萨摩军，也有小部份逃出了首里城，去向军营里的西班牙军送信。
在控制了首里城之后，萨摩军暂时还没对琉球的王室成员下手，但对琉球朝廷中亲明派的大臣可毫不客气，只要是被亲日派指认为亲明派的，什么话都不问，直接杀死，而且还是一家全部杀光。
琉球的亲日派这时也终于扬眉吐气，趁机展开了打击报复。凡事平时和自己不对付，发生过口角，谁骂过自己，谁没借给自已钱，甚至小时候挨过谁的打，受过谁的欺负等等成谷子烂芝麻的旧帐也都翻了起来。不少中立派的官员也都被当成亲明派给杀了，仅是第一天，就杀了两百多人，而到了后来几乎把琉球朝廷的非亲日派官员都杀光了。
结果指认到最后，把别的人都指认光了，在亲日派内部还展开了狗咬狗，甚至出现两人互相揭发对方是亲明派，结果双双都被萨摩藩杀死的事情。
另外被亲日派招集来的士兵有大半都是当地的地痞、无赖流氓、无业游民，于是也趁机在首里城抢砸劫掠，无所不为，结果整个首里城也被弄得一片混乱。
就在萨摩军占领首里城的第二天，桦山久孝以琉球王朝的名议宣布，不许中国商人、中国军队在琉球停留，要求西班牙雇佣军立刻离开琉球，并且派出士兵，对中国商人聚集的村落发动进攻，名议上是要驱赶中国商人，其实的目地是想抢劫中国商人的钱财物资等。
但这时西班牙雇佣兵早就做好了准备，莫伦特派阿尓维斯带领六百名士兵，在半途中布置好了阵式，拦截萨摩军，同时又派人组织中国村的商人们，全都撤进军营里躲避。
萨摩军中大部份都是琉球当地的无业游民，只是被临时纠集起来，并没有受到什么军事训须，本来就是一帮乌合之众，打打琉球兵还可以，一遇到训练有素的西班牙军，那里是对手，一阵排枪齐射，立刻就将萨摩军打得落花流水，作鸟兽散，连桦山久孝也控制不住。
虽然桦山久孝带来的三百名真正的萨摩士兵到是还有一些战斗力，而且战斗志意也不错，但在西班牙军的轮番射击下，仍然被打得不住倒下，根本就无法靠近西班牙军的阵列，不多一会儿，就损失了百余人。桦山久孝见势不妙，也赶忙下令退兵回首里城里去了。
而西班牙军趁机带着中国商人，也全部都平安的撤回了军营里，然后紧闭城门，布置防守。同时又派人立刻乘船回台湾去求救。因为早就做好了相应的准备，因此中国商人们虽然受了些惊吓，但也都平安无事。不过这也是仅限于中国村的商人，如果是住在首里城里，或者是其他地方的中国商人，那就只能听天由命了。
桦山久孝退进首里城之后，当然不甘心失败，立刻招集投降的琉球士兵，一共有两千多人，再一次杀出首里城，向西班牙军的军营发动进攻。
虽然这一次萨摩军的兵力达到了三千多人，但仍然是以琉球军为主力，战斗力并不强，而且斗志极差。而西班牙军早己忍耐了多时，又规在还有城墙可守，结果连火炮都没有用，数百枝火枪在城墙上一起发射，一下子就将琉球士兵打死伤一片，还不等桦山久孝下令，剩下的琉球士兵们就立刻败退了下去。
而西班牙军趁机杀出城来，随后掩杀一阵，将琉球军杀得大败，拆兵近半，桦山久孝无奈，也只好再次退回首里城，也闭门不出来。同时也颇有些害怕，如果西班牙军趁机来反攻首里城，自己也未必抵挡得住，那时首里城再得而复失，自己可也没有办法向藩主交待。
好在第二天，萨摩藩的大军到达琉球登岸，也让桦山久孝大大松了一口气，自己的队伍来了，这仗也就好打了。因此也亲自到码头，将岛津光久一行接进了首里城，就住在琉球的王宫里。然后向岛津光久汇报了夺取首里城的经过。
对桦山久孝的这次行动，岛津光久也十分满意，没能攻下军营，也不能怪岛津光久，是琉球军实在太差了，而且岛津光久也知道，军营里的守军一共也只有一千多人，现在换了萨摩军，岛津光久也信心十足，一定能够攻下军营，把商家军赶走，重新夺回琉球。
不过岛津光久也清楚，琉球离中国同样也不远，从台湾出发的帆船，只用一天的时间，就能够到达琉球，因此也要速战速决，尽快攻开军营，消灭商家军，如果拖到援军到了，可就不好办了。于是就在次日，岛津光久就率领萨摩军，又向军营发动了进攻。
