不过土著的抵抗也并非全无用处，有了这么一会儿的缓冲之后，西班牙军也迅速在修道院里布置好了防守，严阵以待中华军的进攻。
这一次中华军是做好了充份的准备，并没有急于对修道院发动强攻，首先架好十二门火炮，对准修道院就是一阵猛轰。同时又对修道院发射了五十多个霹雳火箭筒。
虽然在修道院里西班牙军也有八门火炮，并且奋力开火还击，但中华军的火力实在太猛，修道院虽然也考遮过军事用途，但毕竟不是真正要塞城堡，由其是对霹雳火箭这种武器，是西班牙军以前从未见过的，虽然它爆炸的威力虽然不是很大，但带出火油四溅非常让人头痛，不少西班牙军的士军身上都被火油溅着，烧得惨叫不断，在地上拼命翻滚。
而且不一会儿，整个修道院里都到处都是火焰浓烟。幸好修道院的主体是石质结构，如果是木质，早就全面燃烧了起来。而在修道院里，也是一片大乱。
中华军这才趁机发动进攻，爆破组用炸药炸开院墙，士兵们趁机杀入修道院里，和西班牙军展开了白刃战，这时在修道院里和西班牙士兵和土著到是也有二千多人，但除了西班牙士兵以后，土著的战斗力极差，而中华军方面，除了十五营和二十三营的士兵以外，李华梅手下的海盗也同样十分捍勇，一个个挥刀抡枪，大砍大杀。而且修道院被攻开之后，双方的心理也产生了极大的变化，西班牙军招架不住，被杀得节节败退，眼看着就己经守不住了。
查孔见状，也立刻下令撤退，而弗朗西斯科这时也不在坚持什么捍卫修道院，老老实实的跟着查孔一起，在西班牙士兵的保护下，撤离了修道院，渡过巴石河，一直逃进了马尼拉城里，才算是安定下来。
回到马尼拉城之后，查孔一面下令菲律宾群岛的所有西班牙士兵及土著，赶到马尼拉城来聚集，并且加强马尼拉城的防御，固守待缓。同时也正式派人到墨西哥去请救援军。并且讫盼上帝。让墨西哥那一边尽早派来援军。而大主教这回也不用总督开口，立刻写信给他的教派，也请救他们的援助。
在总督和大主教撤退了之后，其他的土著更是无心再战下去，纷纷四散败逃，不过只有极少数土著跟着西班牙军一起躲进马尼拉城，而是各自返回各自的部落，向各部落的酋长头人报告战况。
而中华军也趁势攻占了德尔·蒙塔修道院。
宋协昌见取得了战斗的胜利，立刻下令，清理战场、扑灭火势、计查损告，清占收获等等。同时对特意向李华梅交待了中华军的纪律，请李华梅约来手下的海盗，听从调遣，由其是不要哄抢战利品。
虽然修道院里有多处地方着火，但因为修道院主要是石制结构，可燃烧的东西并不多，主要是霹雳火箭里自带油脂在燃烧，火势的蔓延并不大，因此非常容易就全部扑灭了，也没有影响根本，由其在建筑里面的房屋，家俱、储存的物资，几乎都保存了下来。
整个战斗其实用时只有两个多小时，中华军方面仅仅只阵亡了一百五十二人，其中属于十五营和二十三营的士兵为三十三人，海盗方面有六十八人，其余的都是民兵。而这一战打死的敌人数量有八百七十一人，其中西班牙士兵只有五十三人，其余全是土著。
另外还俘虏了土著二百五十三人。缴获了火枪三十七支，各种刀枪武器一千余件，虽然中华军看不上这些武器，但用来给民兵使用，还是很合适的。
尽管十五、二十三营阵亡的人数最少，但在作战的时候，却全部都冲在第一线，几乎所有的突击任务都是由他们完成的，也为这场胜利出力最多，因此海盗对中华军的实际战斗力也佩服不己。因此对中华军的命令也十分服从，另外李华梅对海盗的管理也颇有规据，海盗们也都比较守规据，并没有发生哄抢战利品的情况。当然少数人私藏一些值钱的小物品，这也是再所难免的。
占领了德尔·蒙塔修道院，收获也及为丰富，仅粮食一项就达到四千余石，同时还有五桶葡萄酒，另外还发现了大量的金银币财物，和金银制品。
而在随后，宋协昌也下令，分派部队在巴石河的北岸清理残余的西班牙军和土著，以及在巴石河北岸的西班牙人经营的农场庄园，在三天以后，中华军基本控制了整个比农多地区。并且清剿了七个农场庄园，四家工厂，抓获了西班牙人三十三名，待从五十七名，农奴四百五十二人，又缴获了大量的粮食物资，也彻底解决了目前的粮食压力。而西班牙人的势力，也全部退到了巴石河的南岸。
在比农多区生活的华人也都开始纷纷返回自己的住所安居。而从巴里安区逃过来的华人，也都安排到各个农庄里，同时还付责监督原来的农奴工作。现在所有的农场都己经是属于中华军的产业了，当然不能让它们都荒废了。
这些事情都处理完之后，宋协昌、李华梅、张庚秋、房箴、韦光裕等人也在一起商议，下一步是否应该渡过巴石河，进攻马尼拉城。
但经过了众人的仔细商议之后，终于还决定放弃这个计划，因为马尼拉城可不是德尔·蒙塔修道院，它是西班牙人在吕宋岛，乃至整个菲律宾地区的核心所在，尽管城区的规模并不大，但城防坚固，易守难攻，致少要比修道院难打十倍。因此想要进攻马尼拉城，致少要集中目前中华军的所有兵力才行。
现在中华军己经全面控制了比农多区，需要防守的地区也比原来扩大了好几倍，虽然土著都己经败回了各自的部落，但他们毕竟是长期依附于西班牙人，仍然还是自已的敌人，土著的战斗力虽然不怎么样，但却强在熟悉吕宋岛的环境地形，如果对比农多区发动小规模袭击，也确实很令人头疼。现在中华军还不能对此掉以轻，但这样一来，中华军的大部兵力也只能放在防守上，根本扰抽不出足够的兵力过攻打马尼拉城。
另外十五营、二十三营经过了连继的战斗之后，弹药的消耗尽己经超过了七成，而攻打马尼拉城这样的坚城，如果没有足够的弹药，也是不行的。
而且在宋协昌出发之前，商毅交给他的任务也只是先期到达马尼拉，保护当地华人，现在这个任务基本已经完成了。这一次西班牙人对华人的大屠杀，实际已经被中华军给阻止住了，这样的结果己经很不错了。
因此经过了种种分析之后，众人最终决定，现在还是稳守在比农多区，和西班牙军隔巴石河对持，等商毅的大军到达，然后再对马尼拉城发动进攻。
不过攻占了德尔·蒙塔修道院，控制了比农多地区，也使中华军的威名大增，许多躲进山区里避难的华人也都纷纷逃出来，投到中华军的避护之下。
当然在双方对待期间，中华军也做了一些基础工作，首先是恢复比农多区生活秩序和各种生产经营，同时又派使者，到吕宋岛的一些土著部落，告诉他们继读跟着西班牙人是没有出路的，投靠中华军，才是正确的选择。
而吕宋岛的土著中除了邦班牙族是西班牙人的铁杆小弟之外，其他部族和西班牙殖民者之间都是利益合作关系，不会死心塌地给西班牙军帮忙，而且现在所有土著也都意识到，又有一个强大的势力来到吕宋岛，而且可能比西班牙人更强大。
虽然说绝大多数的土著都不会马上倒向中华军这一边来，但也都决定暂时观望，看一看这两股势力分出战负之后，再作决定。当然也有少数和西班牙人关系不佳的土著部落，都主动来和中华军联络，希望能够和中华军组成联盟，共同对抗西班牙军。
另外随十五、二十三营一起来吕宋岛的传教士也宋协昌等人请求，去游说马尼拉区的其他教会，保持中立，不要帮助西班牙人。
在菲律宾传教的天主教会一共有四个，为奥古斯丁会、方济各会、多明我会、耶稣会。
因为四个教会之间，都存在竞争关系，因此在一五九四年，西班牙国王菲力普二世给各修会划定了传教区域，奥古斯丁会得到了吕宋岛的中南部，包括伊洛戈、邦板牙和彭嘉施兰的一部分地区；方济各会主要在内湖周围和比科尔半岛区域活动，多明我会被安排在吕宋岛北部卡加延山谷和彭加施兰另一部分地区传教；耶稣会则获准在比萨扬群岛的萨马、莱特和宿务等岛屿及棉兰老北部建立教区。
因为奥古斯丁会得到吕宋岛的中南部，实际也就是马尼拉地区的传教权，因此势力最大，而方济各会秒多明我会也在吕宋岛占有一席之地，只有耶稣会在吕宋岛没有一点势力。而阿科尼亚等人也是耶稣会，因此主要就打算游说耶稣会，改旗易帜，转而支持中华军。
